Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSPG4P5Q96PW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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