Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms