Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms