Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms