Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms