Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms