Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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