Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms