Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms