Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC82Q8N4S0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms