Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CNPY4Q8N129 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CNPY4Q8N129 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPY4Q8N129 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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