Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms