Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APLFQ8IW19 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms