Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms