Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms