Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms