Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF220Q5VTB9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms