Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms