Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms