Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms