Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms