Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms