Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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