Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms