Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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