Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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