Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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