Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ACKR1Q16570 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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