Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNGA3Q16281 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNGA3Q16281 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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