Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP6AP1Q15904 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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