Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms