Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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