Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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