Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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