Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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