Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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