Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms