Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RAPSNQ13702 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RAPSNQ13702 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAPSNQ13702 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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