Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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