Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PMS2P3Q13401 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PMS2P3Q13401 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PMS2P3Q13401 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PMS2P3Q13401 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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