Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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AP3B2Q13367 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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