Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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