Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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