Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
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