Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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