Protein–RNA interactions for Protein: Q12962

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF10Q12962 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TAF10Q12962 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12962 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms