Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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BPTFQ12830 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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BPTFQ12830 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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