Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms