Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms