Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDR1Q08345 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 763 ms